Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FZD3Q9NPG1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms