Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA1

KCNMB3, Calcium-activated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB3Q9NPA1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms