Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP62

GCM1, Chorion-specific transcription factor GCMa, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM1Q9NP62 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCM1Q9NP62 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms