Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP29Q9HBJ7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP29Q9HBJ7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP29Q9HBJ7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP29Q9HBJ7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP29Q9HBJ7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP29Q9HBJ7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP29Q9HBJ7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP29Q9HBJ7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP29Q9HBJ7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP29Q9HBJ7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
USP29Q9HBJ7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
USP29Q9HBJ7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP29Q9HBJ7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP29Q9HBJ7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP29Q9HBJ7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP29Q9HBJ7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP29Q9HBJ7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP29Q9HBJ7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP29Q9HBJ7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
USP29Q9HBJ7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP29Q9HBJ7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP29Q9HBJ7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP29Q9HBJ7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP29Q9HBJ7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
USP29Q9HBJ7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP29Q9HBJ7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP29Q9HBJ7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP29Q9HBJ7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP29Q9HBJ7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP29Q9HBJ7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP29Q9HBJ7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP29Q9HBJ7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
USP29Q9HBJ7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP29Q9HBJ7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP29Q9HBJ7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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USP29Q9HBJ7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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USP29Q9HBJ7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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