Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms