Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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