Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2K0

MTIF3, Translation initiation factor IF-3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTIF3Q9H2K0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTIF3Q9H2K0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms