Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms