Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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FOXQ1Q9C009 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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