Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOL6Q9BWW8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOL6Q9BWW8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOL6Q9BWW8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOL6Q9BWW8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOL6Q9BWW8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOL6Q9BWW8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOL6Q9BWW8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
APOL6Q9BWW8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOL6Q9BWW8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOL6Q9BWW8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOL6Q9BWW8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOL6Q9BWW8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOL6Q9BWW8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOL6Q9BWW8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
APOL6Q9BWW8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms