Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH6

RPAP1, RNA polymerase II-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP1Q9BWH6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms