Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms