Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms