Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SRSF8Q9BRL6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SRSF8Q9BRL6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF8Q9BRL6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF8Q9BRL6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF8Q9BRL6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF8Q9BRL6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF8Q9BRL6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF8Q9BRL6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF8Q9BRL6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF8Q9BRL6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF8Q9BRL6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF8Q9BRL6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF8Q9BRL6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF8Q9BRL6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF8Q9BRL6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF8Q9BRL6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms