Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms