Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL1Q99990 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL1Q99990 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL1Q99990 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL1Q99990 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL1Q99990 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL1Q99990 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL1Q99990 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL1Q99990 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VGLL1Q99990 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL1Q99990 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL1Q99990 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VGLL1Q99990 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL1Q99990 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL1Q99990 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL1Q99990 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL1Q99990 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL1Q99990 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL1Q99990 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL1Q99990 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL1Q99990 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL1Q99990 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL1Q99990 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL1Q99990 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL1Q99990 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL1Q99990 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VGLL1Q99990 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL1Q99990 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL1Q99990 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL1Q99990 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL1Q99990 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL1Q99990 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL1Q99990 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL1Q99990 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL1Q99990 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL1Q99990 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL1Q99990 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL1Q99990 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL1Q99990 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL1Q99990 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL1Q99990 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL1Q99990 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL1Q99990 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL1Q99990 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VGLL1Q99990 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL1Q99990 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL1Q99990 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL1Q99990 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL1Q99990 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL1Q99990 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL1Q99990 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL1Q99990 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL1Q99990 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VGLL1Q99990 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VGLL1Q99990 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VGLL1Q99990 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VGLL1Q99990 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VGLL1Q99990 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VGLL1Q99990 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VGLL1Q99990 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VGLL1Q99990 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VGLL1Q99990 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VGLL1Q99990 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VGLL1Q99990 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VGLL1Q99990 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VGLL1Q99990 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VGLL1Q99990 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VGLL1Q99990 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VGLL1Q99990 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VGLL1Q99990 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VGLL1Q99990 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
VGLL1Q99990 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VGLL1Q99990 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VGLL1Q99990 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VGLL1Q99990 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VGLL1Q99990 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VGLL1Q99990 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VGLL1Q99990 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VGLL1Q99990 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VGLL1Q99990 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VGLL1Q99990 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.05■□□□□ 0
VGLL1Q99990 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VGLL1Q99990 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VGLL1Q99990 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VGLL1Q99990 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VGLL1Q99990 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VGLL1Q99990 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VGLL1Q99990 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VGLL1Q99990 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VGLL1Q99990 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VGLL1Q99990 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
VGLL1Q99990 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VGLL1Q99990 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VGLL1Q99990 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VGLL1Q99990 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VGLL1Q99990 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VGLL1Q99990 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VGLL1Q99990 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VGLL1Q99990 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms