Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms