Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms