Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms