Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms