Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms