Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR4

FAM19A4, Protein FAM19A4, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM19A4Q96LR4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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FAM19A4Q96LR4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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FAM19A4Q96LR4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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FAM19A4Q96LR4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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FAM19A4Q96LR4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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FAM19A4Q96LR4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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FAM19A4Q96LR4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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FAM19A4Q96LR4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FAM19A4Q96LR4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM19A4Q96LR4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM19A4Q96LR4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM19A4Q96LR4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM19A4Q96LR4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM19A4Q96LR4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM19A4Q96LR4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM19A4Q96LR4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM19A4Q96LR4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM19A4Q96LR4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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