Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms