Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms