Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms