Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC29■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC29■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC29■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC29■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms