Protein–RNA interactions for Protein: Q96GN5

CDCA7L, Cell division cycle-associated 7-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7LQ96GN5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA7LQ96GN5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDCA7LQ96GN5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDCA7LQ96GN5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDCA7LQ96GN5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDCA7LQ96GN5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms