Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms