Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms