Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
TRIM52Q96A61 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms