Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
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