Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVR3

C7orf43, Uncharacterized protein C7orf43, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf43Q8WVR3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C7orf43Q8WVR3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C7orf43Q8WVR3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
C7orf43Q8WVR3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C7orf43Q8WVR3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C7orf43Q8WVR3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C7orf43Q8WVR3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
C7orf43Q8WVR3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C7orf43Q8WVR3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C7orf43Q8WVR3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C7orf43Q8WVR3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C7orf43Q8WVR3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C7orf43Q8WVR3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C7orf43Q8WVR3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C7orf43Q8WVR3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C7orf43Q8WVR3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C7orf43Q8WVR3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C7orf43Q8WVR3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C7orf43Q8WVR3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C7orf43Q8WVR3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C7orf43Q8WVR3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C7orf43Q8WVR3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C7orf43Q8WVR3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C7orf43Q8WVR3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C7orf43Q8WVR3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C7orf43Q8WVR3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C7orf43Q8WVR3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
C7orf43Q8WVR3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C7orf43Q8WVR3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C7orf43Q8WVR3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C7orf43Q8WVR3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C7orf43Q8WVR3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C7orf43Q8WVR3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C7orf43Q8WVR3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C7orf43Q8WVR3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C7orf43Q8WVR3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C7orf43Q8WVR3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C7orf43Q8WVR3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
C7orf43Q8WVR3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C7orf43Q8WVR3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C7orf43Q8WVR3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C7orf43Q8WVR3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
C7orf43Q8WVR3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms