Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms