Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA4

GTF3C2, General transcription factor 3C polypeptide 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2Q8WUA4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms