Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms