Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLHDC4Q8TBB5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLHDC4Q8TBB5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLHDC4Q8TBB5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
KLHDC4Q8TBB5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLHDC4Q8TBB5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLHDC4Q8TBB5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLHDC4Q8TBB5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLHDC4Q8TBB5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLHDC4Q8TBB5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLHDC4Q8TBB5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLHDC4Q8TBB5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHDC4Q8TBB5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHDC4Q8TBB5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHDC4Q8TBB5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHDC4Q8TBB5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHDC4Q8TBB5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHDC4Q8TBB5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHDC4Q8TBB5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHDC4Q8TBB5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHDC4Q8TBB5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHDC4Q8TBB5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHDC4Q8TBB5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHDC4Q8TBB5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms