Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms