Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms