Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME8Q8N427 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME8Q8N427 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME8Q8N427 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME8Q8N427 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME8Q8N427 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME8Q8N427 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME8Q8N427 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME8Q8N427 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME8Q8N427 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NME8Q8N427 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NME8Q8N427 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NME8Q8N427 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME8Q8N427 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME8Q8N427 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME8Q8N427 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NME8Q8N427 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME8Q8N427 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME8Q8N427 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME8Q8N427 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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