Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms