Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms