Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms