Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L2Q6R6M4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms