Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms