Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms