Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms