Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms