Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
CARMIL2Q6F5E8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms