Protein–RNA interactions for Protein: Q68G75

LEMD1, LEM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD1Q68G75 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms