Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC102BQ68D86 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC102BQ68D86 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC102BQ68D86 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC102BQ68D86 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC102BQ68D86 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC102BQ68D86 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC102BQ68D86 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC102BQ68D86 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC102BQ68D86 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC102BQ68D86 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC102BQ68D86 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC102BQ68D86 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC102BQ68D86 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC102BQ68D86 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC102BQ68D86 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC102BQ68D86 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC102BQ68D86 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC102BQ68D86 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC102BQ68D86 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC102BQ68D86 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms